Что такое файл CEL
Affimetrix разработала программу анализа снимков ДНК, которая использует файлы в формате CEL. Такой файл содержит все типы данных, которые получены с датчиков. Эти данные хранятся в GeneChip, который может содержать большое количество различных данных. Таким образом, файлы CEL обычно имеют довольно большой размер. Файлы CEL можно использовать для создания двумерной сетки или изображения генома после анализа и визуализации данных внутри файла.
Обычно в каждом эксперименте используется один GeneChip. Они созданы из силикона или стекла и содержат датчик. Данные, полученные с помощью таких датчиков, которые содержат схожие и несопоставимые значения, сохраняются в формате файла CEL. Они, в частности, используются при исследовании заболеваний как у животных, так и у людей, поскольку такие данные могут показать изменения в ДНК задействованного датчика. Файлы CEL сохраняются как в двоичном формате, так и в формате ASCII (в зависимости от версии файла). Кроме того, файл CEL может использоваться только с соответствующим файлом CDF. В файле CDF хранится словарь, относящийся к данным датчика файла CEL.
Вот небольшой, но неполный список программ, которые могут открывать документы CEL:
- Affymetrix Tiling Analysis Software (Windows)
- dChip (Windows)
- multi-aff-py (Windows, Mac & Linux)
- RMAExpress (Windows)
- The MathWorks MATLAB (Windows)
- VSN GenStat (Windows)
